HDL是体积最小的脂蛋白，和其他脂蛋白相比，HDL含蛋白量最大（＞50%），其主要的载脂蛋白为ApoAⅠ、AⅡ及少量的ApoC、E；磷脂是其主要的脂质，还有少量的胆固醇、胆固醇酯和甘油三酯在卵磷脂胆固醇酰基转移酶（LCAT）的作用下，游离胆固醇变成胆固醇酯，经过HDL将蓄积在组织的游离胆固醇运送到肝，减少血浆HDL中游离胆固醇的浓度，形成胆固醇从细胞膜流向血浆脂蛋白的浓度梯度，降低组织胆固醇的沉积，从而限制动脉粥样硬化的发生、发展，起到抗动脉粥样硬化作用。所以，血浆中HDL和动脉粥样硬化的发生呈负相关。
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