生化分析仪的基本工作原理是由单色光束照射比色皿内的有色液体，通过被测样本对光能量的吸收，由探测器（光电转换器）将光信号转换成相应的电信号，该信号经放大、整流、并转换成数字信号，送入计算机，同时计算机控制驱动电力驱动滤光片轮和样本盘，计算机再根据用户选择的工作方式对测量数据进行处理、运算、分析、保存，打印机同时打印出相应的结果。最后，在测完每组样本之后进行比色皿和管路清洗。
由于生化分析仪测量速度快、准确性高、消耗试剂量小，现已在各级医院、防疫站、计划生育服务站得到广泛使用。配合使用可大大提高常规生化检验的效率及收益。
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