3D Ion Torrent(TM) 文库定量-CN

下一代测序(NGS) 工作流程中，模板制备步骤是在Ion PGM™ 和Ion Proton™ 平台上获得最佳测序产量的关键，文库输入量是其中的决定性因素。文库浓度过高或过低都会导致总读取数下降，从而降低系统的总通量。因此，在模板制备之前，精确的高质量文库定量方法是使测序通量最大化的关键。

数字PCR (dPCR) 提供了一种高度精确的定量方法，无需参照或标准曲线即可进行核酸样本的绝对定量。将基于芯片的QuantStudio™ 3D 数字PCR 系统与预先经过验证的Ion Torrent™ 文库定量Assay 相结合，是该应用领域的最佳选择。

QuantStudio™ 3D 数字PCR 芯片将一个标准的PCR 反应混合物分成20,000 个单独的PCR 反应。这种直接的样本稀释过程可以使众多反应中的一部分反应含有目标分子，另一部分则不含有目标分子，分别代表阳性和阴性反应。在双槽式PCR 仪上扩增后，利用定量样本中阴性反应的目标分子比例直接计算样本拷贝数，无需参照标准品或对照品即可对目标样本进行绝对定量。

QuantStudio™ 3D 数字PCR 系统用于NGS 文库定量的主要优点包括：

• ●高度精确且可重复的定量结果，无需标准曲线或参考样本

• ●最少的样本处理步骤，减少了操作时间

• ●密封的芯片耗材，最大程度地降低了扩增片段或其他核酸序列的污染可能

• ●经济实惠的系统和耗材，可大大提高测序结果质量，节省成本

本应用说明介绍了采用QuantStudio™ 3D 数字PCR 系统进行Ion Torrent™ NGS 文库定量的一种简单的工作流程。利用该工作流程可以在Ion PGM™ 或Ion Proton™ 系统上获得稳定的测序数据，无需重复模板化微珠制备步骤，节省了时间和成本。