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这个问题目前仍没有明确答案。 由于机体对HPV起有效的免疫反应，使用非常灵敏的HPV检测方法 [PCR和Hybrid CaptureII]发现，超过90％的HPV阳性者在首次检测阳性后4到6月之内会变成阴性。其原因是病毒已被彻底消除，还是免疫反应将HPV抑制到低于检测方法的灵敏度水平尚不清楚。 病毒是彻底消除还是被抑制可能关系不大，因为大部分可能对HPV有效免疫反应者体内在相当长时间内都不会出现病毒。 只有在免疫能力严重减弱时，少数人会有疣复发或出现其它HPV病变。
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