成分不明确，血清保存期短，至多一年。不能排除血清中含有易变物质，使用血清有可能改变某种细胞在体内的正常状态。血清可能促进某些细胞的生长(成纤维细胞)同时抑制另一类细胞生长(表皮细胞)。血清含一些对细胞产生毒性的物质，影响细胞生长，甚至造成细胞死亡。 取材中可能带入支原体、病毒，对细胞产生潜在影响可能导致实验失败或实验结果不可靠性。 血清制作过程复杂、批间差异大成分不能保持一致使用使得实验和生产的标准化困难，其中的蛋白质使得某些转基因蛋白生物药品生产中分离纯化工作很难完成。 质量不稳定，价格昂贵，进出口管制影响盈利，使用不方便。
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