一、来源不同
1、胚胎干细胞：是早期胚胎（原肠胚期之前）或原始性腺中分离出来的一类细胞。
2、成体干细胞：存在于一种已经分化组织中的未分化细胞。
二、优势不同
1、胚胎干细胞：增殖能力强，分化出细胞种类全，质量好；具有永生化，可以传代建系和迁移、归巢能力；粘附能力强，归巢后不容易老化和丢失；接受信号能力强，能按新环境定型，随机分化。
2、成体干细胞：当成体干细胞被移植入受体中，它们表现出很强的可塑性。
三、劣势不同
1、胚胎干细胞：不容易得到某一种细胞（如只想得到血细胞是很困难的）。
2、成体干细胞：成体干细胞只能分化为所来源的组织和器官的类型的细胞；成体干细胞的发育等级较低,是多能或单能干细胞。
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