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这个和凝胶过滤的介质结构有关，凝胶填料是某些惰性的多孔网状结构物质，多是交联的聚糖如葡聚糖或琼脂糖类物质。当小分子物质能进入其内部，流下时路程较长，而大分子物质却被排除在外部，下来的路程短，所以蛋白在凝胶上移动速度跟分子量有关系。
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