流式细胞仪，就是将检测器换成了光电系统，此时，就不用人眼去观察，而用这个检测系统来进行检测。它可以分析细胞表面的一些抗原的表形，而且还可以分析细胞内的一些抗原以及抗体的表形。
如果分析细胞内的一些物质的时候，要把细胞打口，然后让这些物质能够穿过细胞膜，然后跟细胞内的物质发生特异性结合，我们就可以检测细胞内的一些物质的含量了。这是流式细胞技术的工作基础。
不同荧光标记的细胞显示不同颜色，出来的图像有计算机处理的。
流式细胞仪是一种在荧光显微镜技术上的改良。在我们原来的实验操作技术中，有一种荧光显微技术，基本原理就是抗原可以和细胞发生结合。
这个抗原或者抗体，标记有荧光信号，我们在显微镜下，可以观察这些细胞上面结合了多少荧光物质，然后进行分析。这个需要肉眼经显微镜观测。
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