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基因测序结果怎么看

2023.3.15
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超级艾蛋木啊

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问题一:测序结果怎么分析 测序结果的分析
测序都是从5端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的序列文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。

1.寻找引物

blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对,去除引物序列,找到目的片段。
在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。

批注:PCR产物进行测序的结果可能不包含引物序列

2.将找到的对应目的片段转成*.txt格式

3.下载BioEdit软件

第一:打开Bioedit软件,导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列
File New Alignment Sequence New Sequence 导入拼接好的样品序列和标准参考序列(从TEXT文档利用复制粘贴工具) Apply and close 保存结果 关闭窗口

第二:点击菜单栏上按钮 Accessory Application ,选择 Clustalw Multiple Alignment

File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment

第三:比对结束后,删除比对序列两端的多余序列,使所有序列等长

选择需要编辑的序列 Sequence Edit Sequence 进行序列的编辑 保存修改后结果

第四:选择 Sequence 菜单下的 Gaps ,点击 Lock Gaps

第五:将比对后的序列保存为Fasta 格式文档

4.下载MAGE4.0软件

1) 打开MEGA软件,选择 File 菜单栏中的 Convert To MEGA Format ,把序列文件的格式转换为meg文档保存;
2) 双击序列的meg文档,选择 Nucleotide Sequences ,点击 OK ;
3) 程序运行中询问是否为蛋白编码序列,选择 NO ;
4) 在MEGA操作界面选择 Phylogeny 菜单栏下 Bootstrap Test of Phylogeny 中的 Neibour-Joining ;
5) 选择 Test of Phylogeny 栏中的 Bootsrap , Replications 设定为1 000;在 Options Summary 栏中的 Model 项中,设定参数为 Kimura 2-Paramete r,最后选择 pute ;
6) 将分析结果采用Los Alamos HIV序列库提供的HIV-BLAST和Subtyping工具进行验证。...>>

问题二:dna测序结果分析怎么看进化图 如果是用Sanger测序的话,电泳得到的条带是模板连的互补链,电泳的方向是有3‘段到5’段的,那么从下往上读,就可以的出互补链,根据反向平行,就可以推倒出模板连的碱基序列。

问题三:怎样分析基因测序结果 1.假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行.
2.如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,分析一致的地方以及不一致的地方.

问题四:细菌基因组重测序结果分析报告怎么看 测序只是最基础的,接下来你要做功能基因分析,查找确定哪一些是编码基因的序列,然后做表达检测。。 如果你事先知道自己的目的基因序列,测序结束后,应该可以直接找到。

问题五:高通量基因测序检验报告单怎么看 哪个公司出的,可拨打他们的客服电话。从业人员素质普遍较高,可以很详细解答您的疑问。

问题六:如何看测序的结果与预期相差很大 先注意染色体与基因的关系,一条染色体有多个基因。
所以基因结构变异(碱基对增、减、变)导致一个基因变。染色体结构变异,导致多个基因的重复,缺失,排列顺序的改变等。所以基因突变是某一性状改变,而染色体变异是某一系列性状的改变。

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