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根据微藻自身的营养特点，可通过光能自养和化能异养两种方式来培养微藻。微藻培养用生物反应器一般可分为：封闭式光生物反应器和敞开式光生物反应器。
封闭式光生物反应器比敞开式培养系统有以下优点：
①培养密度高，收获效率也显著提高;
②培养条件易于控制，易于实现高密度培养，对代谢产物积累有利;
③无污染，可实现纯种培养;
④不受地域环境限制，生产期长，可终年生产;
⑤适合于所有微藻的光自养培养，尤其适合于微藻代谢产物产品的生产。
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