蛋白质组学（proteomics）是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质，包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列，蛋白质的丰度，蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。
蛋白质组（proteome）的概念最早在1994年由澳大利亚 Maquaire大学的一个学生 Marc wilkins 提出，蛋白质组被定义为由一个基因组所表达的所有蛋白质。在随后的几年中（2000年以后），蛋白质组学( proteomics) 的概念也随之产生，被用来表示对整个蛋白质组的研究。
转眼到了2022年，新的一年有新的征程，小编精选了去年下半年蛋白质组学相关的科研成果，文章按照研究方向分类好，点击任意一篇题目即可查看往期文章！和我们一起来总结前辈的经验，开启自己新一年的奋斗人生吧！
神经系统相关
科研（IF:14.919）| Nat. Commun.：全基因组测序确定神经系统疾病的血清蛋白质组
综述 | Mol. Neurodegener.阿尔茨海默症的蛋白质组学格局：发病机制和生物标志物发现的新见解
科研（IF:15.992）|Nature子刊：精神分裂症患者炎症失调和加速衰老的分子特征
科研 | 中科院：全蛋白质组关联分析为精神性疾病中蛋白质丰度的遗传组分提供新思路（国人佳作）
科研 | 吉林大学：橙盖鹅膏菌多糖在阿尔茨海默病应用的药理基础（国人佳作）
综述 | Neurosci Biobehav Rev：脑外伤新兴血液生物标志物的生物学意义和临床应用
科研 | 深大医学院：利用神经元衍生的外泌体发现识别认知能力下降的新标志物（国人佳作）
科研 | 首医大：应用TMT定量蛋白质组学发现可诊断和预测多发性硬化症的新型生物标志物（国人佳作）
科研 | 华山医院：通过整合来自大脑和血液的遗传学和蛋白质组学分析鉴定阿尔茨海默病的新药物靶点（国人佳作）
科研 | J Proteome Res: 人血浆淀粉样蛋白的多重质谱分析在阿尔茨海默病诊断中的应用
科研 | 南方医科：蛋白质组学和生物信息学揭示大鼠脊髓挫伤模型急性至亚急性期的神经炎症（国人佳作）
肿瘤相关
综述 | 西湖大学：高通量蛋白质组学和人工智能检测癌症生物标志物（国人佳作）
综述| Mass Spectrom. Rev.：基于质谱的靶向蛋白质组学分析蛋白质突变
科研 | 温州医科：山楂酸抗胰腺癌活性的转录组和蛋白质组分析（国人佳作）
科研 | 上海交大发现癌症调控新策略：宫颈癌中IPO7的增加可促进肿瘤生长（国人佳作）
科研 | 山一大：定量磷酸化蛋白质组学鉴定人垂体神经内分泌肿瘤磷酸化介导的分子通路变化（国人佳作）
科研 | Cell：胰腺导管腺癌的蛋白质基因组学特征
科研|中国药科：定量化学蛋白质组学鉴定过氧化物还原蛋白6在非小细胞肺癌中作为withangulatin A的直接靶点（国人佳作）
科研 | Cancers ：AXL受体酪氨酸激酶信号网络的定量酪氨酸磷酸化蛋白组学研究
科研 | 上海交大：非小细胞肺癌放射敏感性特异性蛋白质组和信号通路网络（国人佳作）
科研 | 中科院&复旦：DDX56 通过 miRNA 调节转录后 Wnt 信号并与肺鳞癌的早期复发有关（国人佳作）
科研 | 郑州大学：马来酸替加色罗通过抑制过氧化物酶体通路抑制食管鳞状细胞癌增殖（国人佳作）
科研 | 上海中医药：转录组和蛋白组研究分析高脂饮食联合AOM/DSS诱导小鼠腺瘤模型（国人佳作）
综述 | Brief. Bioinformatics：癌症系统医学的前景和挑战：从基因到疾病网络
科研 | 中科院：以毒攻毒——砒霜可靶向HSP60，降解p53和survivin（国人佳作）
综述 | Cell：精准肿瘤学的下一个领域:蛋白质基因组学为癌症诊断和治疗提供信息
科研 | 汕大&厦大：基于大规模高分辨率质谱的蛋白质组学分析定义了食管癌治疗靶向的分子亚型（国人佳作）
科研 | 广州中医药：MiR-7/TGF-β2轴维持酸性肿瘤微环境诱导的肺癌转移（国人佳作）
科研 | 南京医科：调控的磷酸化蛋白质组学在肝癌中的作用及靶向干预（国人佳作）
科研 | Redox Biol：SCD1和FABP4促进肿瘤耐药铁死亡
科研 | Mol Cancer.：葡萄膜黑色素瘤的液体活检蛋白质组学揭示与转移风险相关的生物标志物
科研 | J. Hepatol.：血小板反应蛋白1和2联合PEDF抑制肝内胆管癌的血管生成并促进淋巴管生成
科研 | 南方医科：Prrx1促进胶质瘤的干细胞和血管生成（国人佳作）
科研 | Cancer Cell：人脑胶质母细胞瘤的蛋白质基因组学和代谢组学特征
综述 | 同济大学：三阴性乳腺癌肿瘤干细胞研究进展（国人佳作）
科研 |Nature：B细胞源性GABA诱导IL-10+巨噬细胞限制抗肿瘤免疫
科研 | 台湾阳交大：蛋白质组学发现了新的弥漫性大B细胞淋巴瘤亚群（国人佳作）
综述（IF：18.187）| 上海交大：胆囊癌靶向治疗现状（国人佳作）
科研 | 南京大学：AK2通过激活体内TGF-β/Smad通路促进肺腺癌的迁移和侵袭（国人佳作）
综述 | 温州医科大：应用多组学方法探索卵巢癌发生的分子机制（国人佳作）
人体疾病相关
综述 | iScience：蛋白质组学和多组学在精准健康中的全景
科研 | Nature：研究人员发现预防转移性疾病新手段
科研 |J Crohns Colitis：CXCR3配体作为术后克罗恩病复发的生物标志物的作用
系统综述 | Autoimmun Rev：抗磷脂综合征的蛋白质组学和富集的生物学过程
科研 | 清华长庚医院：纤维蛋白原通过促进肝球状体中的细胞聚集和纤连蛋白组装改善肝功能（国人佳作）
科研 | Cell Reports：蛋白质组学分析鉴定在EMT期间视网膜色素上皮细胞中肝脏相关信号
综述 | 海南医学院：利用蛋白质组学评估脓毒症的分子机制（国人佳作）
重磅综述|Mass Spectrom.：含载脂蛋白B的蛋白质组学在心血管研究中的应用
科研 | Ann. Rheum.Dis.:蛋白质组学分析系统性红斑狼疮中性粒细胞的异质性
综述（IF=28.314）| Nature子刊：RNA结合蛋白及其在肾脏疾病中的作用
重磅综述 | Mass Spectrom. :白蛋白在心血管疾病中的新见解-聚焦心衰
科研 | 安徽医科大：右美托咪定通过 PI3K/AKT/Nrf2-NLRP3 通路减轻肝脏缺血再灌注损伤（国人佳作）
科研 | Redox. Biol.：谷胱甘肽-S-转移酶P促进哮喘糖酵解
科研 | 广州医科大：II型肺泡上皮细胞中上调的TSSK4可促进肺纤维化（国人佳作）
科研 | Arthritis Rheumatol.：血清蛋白组学揭示类风湿关节炎发展进程的分子特征
科研 | J. Immunother. Cancer：血清中伊匹单抗水平可作为黑色素瘤患者临床评价的潜在生物标志物
科研 | 季华实验室：基于串联质谱标签的定量蛋白质组学揭示胸部暴露于冲击波诱导脑损伤的通路（国人佳作）
科研 | Leukemia ：基于RPPA的蛋白质组学识别慢性淋巴细胞白血病中具有临床后果的不同表观遗传特征
科研 | Eur. Heart J.: 急性缺血患者心脏中糖基化ApoJ的分子修饰和分泌变化
科研 | 西安交大：定量蛋白质组学揭示滑膜组织上调Olfm4可加重类风湿关节炎炎症（国人佳作）
科研 | Ann. Oncol.：白血病抑制因子是一种新的可预测免疫检验点阻断剂抵抗的生物标志物
科研 | 宁波大学：基于胰蛋白酶水解产生具有双重血管紧张素 I 转化酶和二肽基肽酶 IV 抑制活性的新型西兰花衍生肽（国人佳作）
科研 | 江南大学：妊娠期糖尿病对人初乳蛋白质组和糖化/糖基化蛋白质组的影响（国人佳作）
科研 | Leukemia：STAT3介导的代谢改变促进慢性粒细胞白血病的药物持久性
科研 | 中国农科院：由挤压小豆蛋白经模拟胃肠消化后释放的肽具有抗氧化活性（国人佳作）
科研 | J Am Soc Nephrol：普通人群肾功能下降风险相关蛋白分析
科研 | 中国医科院：ceRNA调节网络可以保护胃肠道细胞免于放射毒性（国人佳作）
科研 | Nat. Commun.: BAD通过4E-BP1控制的小鼠和人类模型的局部翻译来调节乳腺生长形态
科研 | 复旦：外周血单核细胞中与银屑病关节炎发展相关的蛋白质的鉴定：基于iTRAQ的定量蛋白质组学研究（国人佳作）
综述 | EBioMedicine: 炎症性肠道疾病患者抗TNF治疗响应评估：现有和新型生物标志物
科研 | 武汉大学：非酒精性脂肪性肝的治疗新靶点（国人佳作）
科研 | 山东大学：PKG2的药物激活可减轻糖尿病诱导的成骨细胞功能障碍（国人佳作）
科研 | 中国医学科学院：过氧化物酶-4改善糖尿病心肌病脂毒性诱导的氧化应激和细胞凋亡（国人佳作）
新冠相关
科研 | Blood：阿斯利康疫苗诱导的免疫性血栓性血小板减少症研究
科研 | Nature子刊：建立快速检测大型临床样本中SARS-CoV-2的质谱系统
科研 | 蛋白质中心：基于抗体的邻近标记图揭示SARS-CoV-2抑制抗病毒免疫的机制（国人佳作）
科研 | Anal. Chem.: 液相色谱-多反应监测-质谱法测定新冠肺炎患者血清中的REGEN-COV浓度
综述 | 深圳第三人民医院：多组学用于SARS-CoV-2感染的机制研究（国人佳作）
综述｜解放军联勤保障部队第990医院 : 肥胖与新冠肺炎：分子机制，前进方向与治疗机会(国人佳作)
科研 | Nano Today：新型冠状病毒病的初步研究
科研 | Nat Commun：SARS-CoV-2 RNAemia和蛋白质组学轨迹可以为COVID-19重症监护患者提供预后
科研 | 北大医学部：蛋白质组学分析新冠肺炎恢复期胆固醇代谢和心肌功能相关通路的紊乱（国人佳作）
实验方法相关
重磅综述（IF：91.245）| N. Engl. J. Med.：用人工智能预测蛋白质组层面的蛋白质结构
综述 | NATURE: 单细胞蛋白质组学占据了中心地位
科研 | 吉林大学：基于图融合的胃癌相关蛋白预测（国人佳作）
综述 | DescribePROT：氨基酸水平蛋白质结构和功能预测数据库
综述 |Plant Journal ：NGS时代的BSA十年进展
科研 | 国家蛋白质科学中心：组氨酸磷酸化蛋白质组的整合策略（国人佳作）
综述| ACS Cent. Sci.：蛋白质组学为法医调查提供新线索
科研 |Nat. Commun.:利用嵌套式纳米晶片高通量和高效地制备单细胞蛋白组样品
科研（IF：28.547）| Nat. Methods：糖蛋白组学信息学解决方案的社区评价揭示了血清糖肽分析的高性能搜索策略
科研|厦大：DreamDIA的深度表征功能改进了数据独立采集蛋白质组学的分析（国人佳作）
综述 | Acc. Chem. Res.：炔丙基腺苷-L-硒代蛋氨酸：甲基组分析的化学工具
科研 | 暨南大学：建立一种用于分离细胞外囊泡的简易二分式尺寸排阻色谱法（国人佳作）
科研 | Science ：乘风破浪！AI深耕蛋白复合体预测
科研 | 华中科技：用亲和层析和四维蛋白质组学方法系统鉴定血液中与顺铂结合的蛋白质（国人佳作）
科研 | J. Proteome Res. : 基于CD9-HPLC的血清胞外囊泡免疫亲和分离技术
综述 | Cell Syst.:用于蛋白质组学和生物标志物发现的人工智能
科研 | J Extracell Vesicles：多糖壳聚糖有助于从多种生物液体中分离细胞外囊泡
科研 | Nat Commun: IceR提高了整体和单细胞蛋白质组学中的蛋白质组覆盖率和数据完整性
综述｜Curr Opin Chem Biol：基于质谱研究新合成蛋白质的最新进展
综述 | Mass Spectrom. Rev.: 质谱分析前自上而下蛋白质组样品处理的最新进展
综述 | Nat Methods:单分子蛋白质测序技术蓝图
数据库相关
综述 | Nucleic Acids Res.：2022年PRIDE数据库资源：基于质谱的蛋白质组学证据中心
科研 | SPENCER：癌症患者非编码RNA编码小肽的综合数据库
科研 | Nat. Commun.：用于多组学集成和大数据分析的蛋白质组学样本元数据表示（国人佳作）
发育衰老相关
科研 | 浙江大学：首个中枢性性早熟蛋白质组分析揭示多重代谢网络和关键疾病相关蛋白
科研 | 南京医科大：整合蛋白质组分析表明衰老小鼠卵母细胞发育潜力受损过程存在异常RNA剪接（国人佳作）
综述 | Ageing Res. Rev.：人类衰老生物标志物——从多组学视角多维度地理解衰老的进程
科研 | Nature：泛素化蛋白质组的重组决定了秀丽隐杆线虫的衰老
饮食相关
科研 | 浙江工商大学 : 定量蛋白质组学揭示低温真空加热处理的俄罗斯鲟鱼鱼片蛋白质变化与异味的关系(国人佳作)
科研 | 江南大学：双峰骆驼和单峰骆驼间乳脂肪球和乳清的蛋白质组学比较（国人佳作）
综述 | Mass Spectrom Rev.:食物蛋白中的交联反应和对其进行检测的蛋白质组学方法
科研 | 华农：无标记定量蛋白质组学揭示茶叶在厌氧发酵过程中蛋白质降解的活性多肽（国人佳作）
科研 | Food Chem.：蜂蜜蛋白质组学分析-鉴定新西兰麦卢卡蜂蜜的独特肽标记物
人体代谢相关
科研 |中国科学院：多组学分析揭示 PM2.5 诱导的细胞代谢紊乱和整合素信号通路障碍（国人佳作）
科研 | Cell Reports：巨噬细胞极化机制的整体表征和M2型极化抑制剂的鉴定
科研 |香港浸会大学：暴露于环境细颗粒物阻碍了小鼠在高脂饮食代谢中的脾脏功能（国人佳作）
科研 | 天津大学：综合组学分析表明lncRNA MALAT1参与脂质代谢的调节（国人佳作）
科研 | 台湾成功大学：白内源性加合水平及其与清蛋白加合的相关性：儿茶酚雌激素的多个暴露标志物（国人佳作）
科研 | Nat Commun:小鼠组成型Rag GTPase信号转导限制其存活及肝脏空腹代谢损伤
中医药相关
科研 | 广东中医药&复旦：加味补肾益气方治疗小鼠哮喘模型的作用机制（国人佳作）
科研 | 上海中医药：蛋白质组学显示决银颗粒通过诱导自噬对银屑病小鼠模型发挥保护作用
科研 | 福建农林：不同花源的蜂王浆具有不同的伤口愈合机制和成分特征（国人佳作）
科研 | 复旦大学：PP2A通过下调MCL1抑制食管鳞癌对白蛋白-紫杉醇耐药的作用（国人佳作）
科研 | 天津中医药：三叶片改善高脂饮食诱导的肥胖小鼠胰岛素抵抗和脂代谢紊乱
科研 | 北京中医药：双心方对急性心肌梗死后抑郁行为大鼠的心理-心脏病学治疗作用（国人佳作）
科研 | 北京中医药：综合生物信息学揭示复方苦参注射液治疗胃癌中ceRNA网络的关键基因（国人佳作）
科研 | 湖南中医药：基于系统生物学和化学信息学探讨附桂温阳汤治疗血管性痴呆大鼠的生物学机制（国人佳作）
科研 | 中医科学院：蛋白质组学和转录组学揭示介导三七总皂苷对脑缺血损伤保护的关键转录因子（国人佳作）
科研 | 中国农科院：铁毒性诱导调控与人参和西洋参关键次生代谢过程（国人佳作）
重磅 | Nature发表针灸研究历史性突破 ！哈佛大学团队证实“足三里”穴位可以治疗疾病
科研 | 贵州医科大：参芎葡萄糖注射液通过激活ERK信号通路抑制H2O2诱导的H9c2细胞凋亡（国人佳作）
科研 | 北京中医药：保元汤通过ANKRD1-ERK/GATA4通路减轻急性心肌梗死后心力衰竭患者的心肌肥厚（国人佳作）
科研 | 长春中医药：中药复方万年青通过调节免疫反应抑制小鼠肝癌的进展（国人佳作）
农林相关
科研 | Science重磅成果：中国科学家解析植物中独特的双链RNA合成机制
科研 | Nature重磅:水稻广谱抗病的免疫代谢新机制
科研 | 河北科技&北京工商：定量蛋白质组学揭示微酸性电解水诱导荞麦芽生长和黄酮类化合物富集的机制
科研 | 农科院：赤霉素抑制苜蓿黄酮生物合成并促进氮代谢（国人佳作）
科研 | 湖南农业：蛋白质组和赖氨酸乙酰化分析揭示了乙酰化在辣椒抗寒性中的广泛作用（国人佳作）
科研 | 湖南农业：定量蛋白质组学和相对酶活性揭示了两个花生品种在涝渍条件下的不同机制（国人佳作）
科研 | Science：中科院分子植物卓越中心Jeremy Dale Murray团队描绘豆科植物如何建造“固氮工厂”
Nautre背靠背 | 植物生长素领域突破！福建农林大学等揭示生长素“酸性生长假说”的机制
科研 | 西北农林：利用蛋白质组学技术对比耐受性和敏感性桑树揭示苯丙素合成对桑树耐盐性的作用（国人佳作）
科研 | 吉林大学：拟南芥HY2基因在种子萌发过程中对NaCl信号的正调节作用（国人佳作）
科研 | 华南农业：比较转录组和蛋白质组学研究为白灵菇子实体采后变质的调控机制提供新思路（国人佳作）
科研 | 安徽农大：氮调控茶树根中茶氨酸和类黄酮的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调控（国人佳作）
科研 | 南京林业：基于SWATH-MS定量蛋白质组学研究铅胁迫下杨树毒性反应的全蛋白质组（国人佳作）
科研 | 南京林业：基于SWATH-MS定量蛋白质组学研究铅胁迫下杨树毒性反应的全蛋白质组（国人佳作）
科研 | 华农: 定量蛋白质组学分析揭示酯环化酶UvEC1在水稻假黑穗病病原体稻曲病菌致病性中的作用（国人佳作）
科研 | 黑龙江大学: 甜菜BvbHLH93转录因子在盐胁迫耐受中的功能研究（国人佳作）
科研 | 河南农大：TaPHT1；9-4B及其转录调节器TaMYB4-7D对普通小麦的磷酸盐吸收和植物生长的贡献（国人佳作）
畜牧相关
科研 | 江南大学：双峰骆驼和单峰骆驼间乳脂肪球和乳清的蛋白质组学比较（国人佳作）
科研 | 陕师大：应用iTRAQ技术研究中国乌骨鸡和环颈雉蛋清的蛋白质组学（国人佳作）
科研 | 沈阳农业：驴乳和牛乳乳清蛋白差异的新见解（国人佳作）
科研 | Elife：NIC监督肠细胞识别，防止过早衰老
亚细胞和蛋白质研究相关
科研|Nature子刊(IF:28.824) 线粒体衍生囊泡的蛋白质组和脂质组:MDVs在线粒体质量控制中的功能
综述 | Nature 子刊（IF=28.824）：线粒体蛋白质组学研究
科研 | Nature：中科院植物所研究团队首次解析大麦叶绿体PSI-NDH膜蛋白超大分子复合物空间结构
综述 | Trends Biochem. Sci.：在蛋白质组范围内揭示病毒RNA与宿主细胞的相互作用
综述 | Trends Biochem.Sci.：蛋白质结构与聚集：聚集守门人控制的必然结合
科研 | Nature: SLC25A39是哺乳动物细胞线粒体摄取谷胱甘肽的必需蛋白
综述 | 香港大学：化学生物学方法破译组蛋白（国人佳作）
科研 | Nature：痒觉感知的分子机制
科研 | PNAS: 凋亡诱导因子1与线粒体呼吸链上细胞色素C形成的复合物的分子特征
科研 | PNAS: 天然状态的RhopH复合体是疟原虫入侵红细胞获取营养的关键蛋白
科研 | eLife：Cavin3与BRCA1相互作用调节细胞应激反应
科研 | Curr Opin Chem Biol. : 线粒体中ClpP蛋白酶的底物和相互作用网络
科研 | Redox Biol: 质谱法直接检测内质网应激下胰腺β细胞中多种类型的蛋白硫醇修饰
综述 | MOL CELL：蛋白质修饰前沿进展
科研 | 华中师范：在不同小鼠组织中定位微蛋白和ncRNA编码的多肽（国人佳作）
综述 | Curr Opin Chem Biol：活细胞中蛋白质错误折叠和聚集的可视化及分析
微生物
科研 | 湖南农科院：李斯特菌对芳樟醇反应的整体蛋白质组学分析 （国人佳作）
科研 | Nat Commun.: 代谢组和蛋白质组分析揭示工程大肠杆菌糖酵解过程中的转录失调
科研 | Microbiome：多组学揭示近平滑念珠菌对病婴儿微生物组的遗传和适应行为
蛋白质组研究是指系统研究在某一特定时间、特定条件下，某一种特定组织中的所有蛋白质。对蛋白质的研究也不只是局限于蛋白质的氨基酸序列，而是包括了蛋白质的表达量，蛋白质活性，被修饰的状况以及和其他蛋白质或分子的相互作用情况、亚细胞定位和三维结构。这些信息对于全面了解复杂的生物系统有着重要的意义。因此，蛋白质组学研究目标是大规模、系统化地研究蛋白质的特性，以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。
蛋白质组和基因组( genome)在概念上有相关性，代表某一个蛋白质组的蛋白质是由基因组所编码的，然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。
首页
