1光路系统
光路是检测部分的核心，优质先进的光路能够使检测结果更加准确。
（1）单色器与检测器
目前生化分析仪的单色器主要有两种类型，一种是干涉滤光片、第二种是光栅分光式。
干涉滤光片
干涉滤光片价格低，旋转方式选择波长容易，易受潮变质。而且在选择波长的时候伴随机械运动，不但增加了噪声、震动对结果的影响，而且还提高了仪器的故障率。
光栅分光式
无相差蚀刻凹面光栅是当今理想的全息光栅。分光准确，半带宽小，使检测线性提高。光栅使用寿命长，光栅系统无需任何保养，能满足临床化学检测要求。
（2）分光方式
前分光 过去传统是普遍采用前分光。过去的光度计，在光源灯和样品杯之间，先要用滤光片或光栅分光，通过可调的狭缝，取得与样品对单色光的吸收量（吸光度）；
后分光 而后分光则是将一束白光（混色光）先照到样品杯，然后再用光栅分光，然后个检测器检测任何一个波长的广的吸收量。光路中无可动部分，无需移动仪器的任何部件，可选择多个波长，不仅提高了工作效率，减少了故障率，而且显著提高了分析精度。
2温控系统
全自动生化分析仪温度一般设为37℃.温度对实验结果影响很大。因此要求温度控制在±0.3℃。
水浴恒温 早先的自动生化分析仪都是采用水浴。其优点是温度均匀、稳定。缺点是升温缓慢，开机预热时间长，需要加防腐剂。但由于现代技术的发展，有些厂家设计出高速二次预温功能，解决了水浴控温升温缓慢的缺陷。
空气干式浴 优点是升温迅速，无需保养。缺点是温度易受外界环境温度影响，从而导致检测结果不稳定。
恒温液循环间接加热 在比色杯与恒温液间有一几毫米的空气夹缝，恒温液通过加热夹缝的空气达到恒温。其温度稳定性优于干式浴差于恒温水浴，缺点需要定期更换恒温液，成本高昂。
3搅拌和清洗系统
目前先进自动分析仪采用新的搅拌系统。如：迪瑞公司CS-1200分析仪采用独特的平桨式搅拌棒，搅拌棒表面采用特殊不沾图层，具有不粘敷异物、无携带污染物的特点。搅拌棒高速旋转搅拌，搅拌稳定，比色杯内容物不外溢，不产生气泡，使检测结果更准确。
迪瑞CS-1200全自动生化分析仪采用先进的温水八步骤自动冲洗比色杯。是用的抽干技术，使比色杯冲洗更干净、彻底，防止项目间的交叉污染。
4智能化探针系统
探针是自动生化分析仪的基本系统，依靠探针的良好性能来完成样品和试剂装填，因此探针系统是生化分析仪比较重要的系统。
（1）普遍采用三维结构，在三维方向装填移动，回旋余地较大。为了增加速度和减少污染，样品和试剂不采用同一探针。
（2）采用可靠的冲洗，使污染达到较低限度。
（3）随量跟踪技术：探针可依据分注液量的多少，自动调节探针的下降高度。这样，不论需要加注多少样品量或试剂量，探针会自动调节高度，以防止加注液体时液体飞溅到比色杯上，保证超微量检测时的精确。
（4）自动液面探测：探针带有感应装置，探针液面会自动停止下降。这样可以保护探针意外损伤及节省试剂。
5分注系统
样品和试剂的加注有助于检测结果的准确。因此生化分析仪分注系统要求性能优异。
生化分析仪分注器分为普通注射器、陶瓷芯注射器、陶瓷分注泵几类。
普通注射器的优点是价格低廉，缺点精度不高，寿命相对较短。
陶瓷芯注射器的优点是陶瓷芯设计抗磨损能力强，使用寿命长。缺点是精度不高。
陶瓷分注泵为陶瓷芯设计，耐磨能力强，使用寿命更长，同时拥有超高的分注精度，保证使用寿命的同时有保证了加样加试剂的精度，保证了检测结果的高准确性。
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