首先一点，是“反相”色谱，不是“反向”色谱。
正相色谱和反相色谱是这么来的。一般情况下（历史发展的原因），色谱法中固定相一般都是用极性较大物质，比如常用的硅胶柱，而流动相（洗脱剂、展开剂）一般用的是极性很小或者非极性的物质。因此固定相极性大，流动相极性小的色谱被称作正相色谱。发展较早的色谱大多是遵循这个模式，比如薄层色谱（一般都是硅胶涂板，用石油醚等做展开剂），气相色谱GC。
而后来随着液相色谱特别是高效液相色谱HPLC的技术发展的实际需求，出于仪器制造以及应用于生物、有机分子的分析分离的具体实际情况，人们发现，固定相使用极性很小或者非极性的物质，而将流动相使用极性较大的物质，使用效果将会很好。和传统的正相色谱正好相反，因此被命名为反相色谱，即固定相极性小，流动相极性大。现在科研和实际中大量使用的高效液相色谱HPLC绝大多数是反相色谱，用非极性柱或者小极性的柱子，而使用水，乙腈，甲醇，乙醇，丙酮等极性很大的物质来配制流动相。
非极性色谱这里的非极性指的是色谱柱材料是非极性。根据上面关于反相色谱的论述，你应该可以知道了，很多反相色谱的色谱柱用的是非极性物质，因此很多反相色谱其实也可以被叫做非极性色谱。只要使用的柱子是非极性的即可，常用的聚二甲基硅氧烷做填充柱固定相就是一个典型的非极性色谱。当然有非极性色谱，也有弱极性色谱，中等极性色谱，强极性色谱的命名。
注意，和上面一个概念的区别是，非极性色谱是另一种命名体系。这种命名关注的是固定相的极性大小。而正相色谱反相色谱关注的是固定相和流动相哪个极性更大，固定相极性大于流动相就可以称作正相色谱，而固定相极性小于流动相就可以被叫做反相色谱。
液液色谱则是另一种命名，根据的是流动相和固定相的状态。一般情况下，固定相都是固态，流动相为液态或者气态。而液液色谱则固定相和流动相都为液态，这个某种意义上来说和萃取有点像（只是原理有点像）。当然这是针对特殊的工艺要求或者分离要求而发展的。液液色谱有几个特殊的要求，第一是流动相和固定相一定要不互溶，不然分不开；第二是由于固定相是液体，因此还需要有载体（不然也流掉了怎么算固定相啊）。载体起到吸附固定相的作用。液液色谱的优势是一般应用于实际的分离中，因为一般的色谱都是固定相是一定的然后调整流动相的极性（溶剂的配比）来取得较好的分离效果。但是很多实际条件下由于制得的样品需要特殊的存在环境，因此成品往往直接作为流动相，流动相是不能变的，只能调整固定相的吸附能力来测试分离效果。所以液液色谱的优势体现在这里，载体一般用的是多孔硅胶或者是均匀的硅胶藻土全多孔型载体，只要把需要的固定相涂在上面，就可以进行分析。如果极性不合适，也可以在换涂其他的固定相。
液液色谱的缺点是固定相是涂在载体上的，因此载体和固定相之间的相互作用就是吸附作用，流动相不可避免地会冲刷下一部分的固定相。为了弥补上述缺陷，70年代初发展了一种新型的固定相叫做化学键合固定相。这种固定相是通过化学反应把各种不同的有机基因键合，用化学键的作用来取代吸附作用。为了与传统的液液色谱相区别，这种色谱被称作化学键合相色谱（简称键合相色谱或者键合色谱）。现在键合相色谱在大多数时候已经取代了传统的液液色谱。
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