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溴甲烷对一般材料进行消毒作业时无影响,但对于可以被溴甲烷溶解的材料来说比如PVC,在熏蒸中可能会有少许ppm残留,而且如果含有可食用部份,不确定溴甲烷是否会与其发生化学反应而产生有毒产物存留——溴甲烷并不是单单的熏蒸消毒气体,它本身也是一种非常强的烷基化试剂,与碘甲烷、硫酸二甲酯等等一样具有潜在致癌的生理毒性,请参考。溴甲烷也可以像二氯甲烷一样溶解很多食品级树脂材料。