T-ICR与回旋加速器（cyclotron）的物理学原理十分相似，至少在第一近似值方面二者相差无几。
在最简单的理想状态下，回旋频率和质荷比之间的关系可以用如下的公式来表示：看第三个公式
ω c =回旋频率（一般测量角频率）z =离子电荷 B =磁场强度 m =离子质量
由于在实际应用中我们用了一个四极的电场把离子限制在轴向中，这种诱捕装置会使离子产生震动，从而影响到其（角）频率:
【Wiki上这里的公式也没有】
α是一个常量（和谐振装置的刚度常数类似），是由电压、诱捕阱尺寸及其几何构造共同决定的。
电场及其造成的轴向谐振运动在减弱回旋频率的同时，其磁控管频率催生了另外一种被称为磁控运动的轴向运动。尽管在计算中仍然使用回旋运动的频率来表示，但实际上这一频率并不完全是由回旋现象本身决定的，真正的的角频率应当是这样的：
【Wiki上这里的公式还是没有】
ωt是诱捕行为产生的轴向谐振频率，ω+是被减弱了的回旋角频率，ω–是由磁控管影响产生的角频率。ω+一般是我们使用FT-ICR时测量得到的值
当我们假设ωt非常小的时候，这个公式就不难理解了，事实上也确实如此。在这种情况下，ωt的根基值略小于ωc/2, ω+的值略小于ωc（回旋频率被略微降低了）。ω–的情况也一样（其根基值略小于ωc/2），并且ωc/2减去ω–的值与ωc减去ω+的值相等。这个差值正是回旋频率被减掉的精确值。
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