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PCR循环次数通常就是30左右。循环数太多了，虽然可以一定程度的提高产物量，但是由于反应时间过长，有一些非特异产物的扩增也会相应增加，而且随着酶的扩增能力下降，合成目标片段的能力也会随之下降，也可能引起其他的非特异扩增。dNTP也会消耗，如果有某一种dNTP消耗比较大，后续扩增就难免会引起错配。所以如果产物已经足够用于后续分析，一般都不太会过度延长循环次数的。
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