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盐浓度对蛋白质的活性还是比较关键的。我觉得你的解决方法可以从下面几个方面去考虑。第一加一些保护剂,如蔗糖,甘油,巯基乙醇等。第二,如果你仅仅为了脱盐的话,减少脱盐时间。考虑用超滤或者G系列的凝胶脱盐,这样时间较快,减少蛋白质的变性。第三,增加你的蛋白质浓度,一定程度也可以减少透析过程中蛋白质的沉淀,但是效果不是特别好的。你可以试试。