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蛋白质工程是开发有用或有价值的蛋白质的过程。它是一门年轻的学科，正在对蛋白质折叠的理解和蛋白质设计原理的识别方面进行大量研究。它也是一个产品和服务市场，到2017年估计价值为1,680亿美元。
蛋白质工程有两种通用策略：合理的蛋白质设计和定向进化。这些方法不是互斥的。研究人员经常会同时使用这两种方法。将来，对蛋白质结构和功能的更详细了解以及高通量筛选的进步可能会xxx扩展蛋白质工程的能力。最终，甚至可以通过较新的方法（包括扩展的遗传密码）包括非天然氨基酸，该方法允许以遗传密码编码新氨基酸。
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