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基因敲除一般指永久的、不可逆转的敲除/失活靶基因，目前其中一种热门的，常见的基因敲除方法是CRISPR/Cas9，利用gRNA靶向靶基因并指导cas9切割基因双链，形成移码突变或片段敲除来完成基因敲除。基因沉默与基因敲除不同的地方在于，沉默可以是暂时性的、可逆转的失活基因/抑制基因表达，基因可以是存在于基因组中，只是基因表达被抑制了，生物技术范畴里面通常指的是RNA干扰，不同基因沉默/RNA干扰方法的不同点在于RNA的类型，如miRNA，siRNA，shRNA等。
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