吡咯赖氨酸在产甲烷菌的甲胺甲基转移酶中发现，是已知的第22种参与蛋白质生物合成的氨基酸，与标准氨基酸不同的是，它由终止密码子UAG的有义编码形成。与之对应的在产甲烷菌中也含有特异的吡咯赖氨酰－tRNA合成酶(PylRS)和吡咯赖氨酸tRNA(tRNA(上标 Pyl))具有不同于经典tRNA的特殊结构。产甲烷菌通过直接途径和间接途径这两种途径生成吡咯赖氨酰－tRNA(上标 Pyl)(Pyl-tRNA(上标 Pyl))，它还可能通过mRNA上的特殊结构以及其他还未发现的机制，控制UAG编码成为终止密码子或者吡咯赖氨酸。
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