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植物亚麻酸的分解代谢的主要去路可以总结为三个部分。其一与其他脂肪酸一致,发生β-氧化最终分解产生乙酰CoA,这是亚麻酸作为贮存脂肪酸分解提供能量的主要方式;其二是受到氧化自由基的攻击而发生自动氧化反应分解为低碳链脂肪酸或者脂质自由基;其三则是分解产生植物生长调节物质茉莉酸。