1.内科治疗
由于附睾炎的病因是细菌性而不是尿液逆流，所以应采用药物治疗。急性附睾炎的致病菌常由肠道细菌或铜绿假单胞菌引起，多见于中老年男性。抗菌药物的选择应按细菌培养以及抗菌药物敏感试验来决定。如对甲氧苄啶（复方新诺明）敏感，应每天口服2次共4周，特别是伴有细菌性前列腺炎者更为有用。若局部红肿明显，血白细胞数增多，体温上升，应静脉滴入抗生素，至体温正常，改口服抗生素。
其他一般支持疗法：在急性附睾炎期间应卧床休息。阴囊用人工托，可以减轻疼痛。如附睾疼痛较重，可用1%利多卡因20ml由睾丸上端处精索行局部注射，减轻不适，亦可用口服止痛及退热药。在早期可将冰袋放在附睾处，防止肿胀。晚期可用热敷，加速炎症消失，减轻患者不适。有时应用吲哚美辛（消炎痛）亦可减轻症状。急性期间避免性生活、体力活动，二者均可加重感染症状。
2.外科治疗
绝大多数急性附睾炎经药物治疗后自行消失，但有3%～9%病例在急性期1个月发生脓肿。
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