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基因检测并非万能,5000人测试10.9%漏检

2022.8.12
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TBiotin

whisper of insanity

  一项新的研究发现,对疑似患有心肌病或心律失常的患者进行更全面的基因检测会导致额外的诊断,而这些诊断可能会因疾病特异性检测而被遗漏。

  西北大学的研究人员指出,通过更广泛的测试提高诊断率的可能性与收到不确定结果的可能性更大之间存在紧张关系。

  为了更好地了解扩展测试的结果,他们通过 Invitae 赞助的免费项目进行了一项队列研究,涉及广泛的心肌病和心律失常基因检测。在这项研究中,近 5000 名疑似遗传性心肌病或心律失常的患者接受了一系列疾病相关基因的基因检测。研究人员随后将广泛测试的结果与如果寻求更窄的、特定疾病的测试所获得的结果进行比较,正如他们本周在 JAMA 心脏病学杂志上报道的那样。

  “值得注意的是,这项研究发现,如果测试仅限于与单一心肌病或心律失常亚型相关的基因,则可能会错过 10.9% 的基因诊断,”资深作者、西北大学研究员伊丽莎白麦克纳利和她的同事在他们的论文。

  在为期 12 个月的研究期间,临床医生转诊了 4,782 名无关患者进行检测,其中包含多达 150 个基因。根据个人或家族史,临床医生怀疑任何程度的遗传性心肌病或心律失常的患者都可以被纳入研究。

  总体而言,19.9% 的队列接受了分子诊断。怀疑遗传性心肌病或心律失常的患者比怀疑水平较低的患者更有可能获得阳性结果。然而,研究人员指出,11 名怀疑程度较低的患者也获得了阳性结果。

  诊断率因条件和患者年龄而异。在怀疑患有肥厚型心肌病的 19 至 39 岁的患者中观察到最高的检出率为 40.4%。与此同时,被认为患有长 QT 综合征的患者的诊断率为 26.1%。

  研究人员指出,这种联合测试方法确定了五分之一患者的临床相关变异。在 JAMA Cardiology 的相关评论中,由悉尼大学的 Christopher Semsarian 领导的研究人员指出,这一比率可能很低,因为临床医生可能会转诊临床怀疑程度较低的患者,因为该研究中使用了免费、赞助的基因检测计划.

  对于大约三分之二的阳性结果患者,或接受测试的所有患者中的八分之一,这些发现将支持更严格的临床监测或改变药物或医疗设备的使用。此外,对于 6% 的患者,阳性结果是针对具有靶向分子治疗的基因。

  研究人员还将他们更广泛的测试方法与特定疾病测试所揭示的结果进行了比较。如果检测是基于临床医生提供的诊断指征,则会错过超过 10% 的阳性结果。他们指出,在 689 名结果呈阳性和特定适应症的患者中,3.9% 的患者被诊断为心律失常,但心肌病检测结果呈阳性,反之亦然。

  研究结果向研究人员表明,全面的基因检测提供了可以改变临床管理的诊断和预后信息。他们补充说,识别额外病例的好处超过了检测具有不确定意义的变异所带来的风险,这些变异在他们的队列中有 51.2% 的人发现。

  “一个重要的信息是制定一个管理计划来处理意义不确定的变异发现,从预测试遗传咨询到评估变异致病性的专业知识,并与功能基因组学平台和机器学习算法建立潜在联系,以解决其中的许多问题尽可能不确定的发现,”Semsarian 及其同事在他们的评论中补充道。

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