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有一部分的细胞核核膜会向细胞质延伸，形成许多相通的小管与囊袋，构成迷宫状的网络，称为内质网，部分内质网上附着著核糖体，称为粗糙内质网(粗面内质网)，其他的部分则称为平滑内质网(滑面内质网)。而平滑内质网上有特殊的酶系统，负责合成脂质和胆固醇，也能够氧化有毒物质以减低毒性，在肝脏协助可调节血糖，在肌肉细胞可储存许多钙离子协助肌肉收缩；粗糙内质网则和蛋白质的合成有密切关联，附着在粗糙内质网的核糖体所制造的蛋白质，主要运送到膜上，或是分泌出细胞之外。
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