按结构分类
根据结构的同源性，可以将细胞因子分为四种类型：
四α螺旋束家族：其三维结构有四束α螺旋。这个家族又分为三个亚家族：
白细胞介素-2亚族。这一亚族成员最多。它还包括一些非免疫性的细胞因子如红细胞生成素和血小板生成素。
干扰素亚族
白细胞介素-10亚族
白细胞介素-1家族：主要包括白细胞介素-1和白细胞介素-18。
白细胞介素-17家族
胱氨酸结类
按临床和实验功能可以把一些细胞因子分为：
I型辅助T细胞（Th1）细胞因子，如干扰素伽玛。
II型辅助T细胞（Th2）细胞因子，如白细胞介素-4，白细胞介素-13，白细胞介素10和转化生长因子β等。这两类细胞因子倾向于相互抑制。
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