能阻断呼吸链某一部位电子传递的物质称为呼吸链抑制剂。
鱼藤酮、安密妥(或阿米妥)在NADH脱氢酶处抑制电子传递，阻断NADH的氧化，但FADH2的氧化仍然能进行。
抗霉素A抑制电子在细胞色素bc1复合体处的传递。
氰化物、CO、叠氮化物（N3-）抑制细胞色素氧化酶。
对电子传递及ADP磷酸化均有抑制作用的物质称氧化磷酸化抑制剂，如寡霉素。
已知的电子传递链抑制剂及抑制部位如下：
作用物→NAD→〈FMN（Fe-S）〉→CoQ→Cytb→Cytc1→Cytc→Cytaa3→O2
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............................................安密妥.鱼藤酮.....抗霉素...........................CO.CN-
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