酶(enzymes) 这是一类具有高度催化活性和专一性的特殊蛋白质。生物体中蛋白质、脂肪和糖类等的合成与降解，以及生命活动中许多复杂的化学变化均与酶有密切关系。已发现约700种酶，按功用可分为转移酶(transferases)、水解酶(hydrolases)、氧化还原酶(oxidoreductases)、裂解酶(lyases)、异构酶(isomerases)和连接酶(ligases)或合成酶(synthetases)等六类。在机体内有些酶具有不同的结构和大小，但具有相同的催化功能，这些酶特称为同功酶(isozymes)，如异柠檬酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶和RNA酶等都属于同功酶。酶的结构中常结合一种非蛋白质的有机分子或一种金属，统称为辅酶(co-enzymes)。有的酶已在临床应用，如淀粉酶与胃蛋白酶能助消化，链激酶能溶解血凝瘀块和脓肿，无花果蛋白质酶能杀寄生虫，菠萝蛋白酶等抗炎等。
酶的性质与鉴别反应，同蛋白质。
肽是蛋白质水解的中间产物，一般指由2～20个氨基酸组成的物质，具直链或环状结构。20个以上氨基酸组成的多肽与蛋白质无明显界限。不少多肽具生物活性。如水蛭多肽能凝血，蛙皮多肽能舒张血管，海兔抑制素能抗肿瘤。植物多肽有的是环肽，具-S-链，如毒蕈环肽，有的带肽的生物碱具降血压作用。还有白花蛇舌草中的催产肽，人参中的抗脂质分解的多肽等。
多肽类成分一般可溶于水，在热水中不凝固。可与茚三酮、吲哚醌试剂显色，又因分子中具肽链而有双缩脲反应。
蛋白质分子与多肽的主要区别在于蛋白质空间结构更复杂。多肽是α－氨基酸以肽键连接在一起而形成的化合物，它也是蛋白质水解的中间产物。由两个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫做二肽，同理类推还有三肽、四肽、五肽等。通常由三个或三个以上氨基酸分子脱水缩合而成的化合物都可以成为叫多肽。 在高二选修有机化学基础中有对多肽的明确定义。蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。蛋白质是由氨基酸以“脱水缩合”的方式组成的多肽链经过盘曲折叠形成的具有一定空间结构的物质。另外，蛋白质是具有高度种属特异性的大分子，不易吸收，必须经过消化过程分解为氨基酸或小肽才能吸收。小肽能以完整形式被吸收进入循环系统时，没有任何废物及代谢物，能被人体全部利用。
蛋白质的分子量很大，一般在一万以上，分子量越大，表面的抗原决定簇就越多，化学结构也较稳定，不易被机体破坏或排除，在体内停留时间也较长，有充分的机会与产生抗体的细胞接触，刺激机体产生免疫反应。而小分子肽具有低抗原性或无抗原性。
蛋白质被摄入人体后，经过分解主要以氨基酸和小肽的形式被小肠吸收利用。小分子肽与氨基酸的区别主要表现如下：
（1）小分子肽的吸收代谢速度比游离氨基酸快，并且人体内利用小分子肽合成蛋白质的概率比氨基酸的利用率高约25%。
（2）小分子肽与氨基酸吸收机制完全不同。小分子肽吸收具有转运速度快、耗能低、载体不易饱和、无竞争性和抑制性等特点。
（3）人体能够吸收和利用的氨基酸只有20种。但是，不同种类不同数量的氨基酸，通过排列组合则可以构筑成百上千种小分子肽。这些小分子肽可以发挥各种各样的生物学作用。
（4）小分子肽具有氨基酸不可比拟的生理功能，它直接介人血细胞、脑和神经细胞、肌肉细胞、生殖细胞、内分泌细胞和皮肤细胞的新陈代谢，并且参与调节机体的各项生理功能。
与氨基酸运输体系相比，小分子肽具有吸收快速、生物利用效率高、耗能低、不易饱和等特点，因而可以利用小分子肽为某些特殊身体状况的人群补充营养。
比如手术后特别是消化道手术后，尚处于康复期的患者；因精神压力、过度劳累及厌食等引起的肠胃功能失调者；运动后需及时快速补充氮源者；消化器官未发育成熟的婴幼儿或消化吸收功能开始衰退的老人等。
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