1、 病原学检查 是诊断肺隐球菌病的重要依据,对拟诊的病例应尽可能的多次、多途径采集标本进行涂片和培养。痰培养和涂片检查的阳性率一般低于25%,对谈涂片采用墨汁染色,可见圆形厚壁孢子,可有出芽现象。将痰标本接种于葡萄糖蛋白胨琼脂培养基上,培养2~5d即可生长。但由于新生隐球菌可以寄居于正常人群,因此痰液甚至气管冲洗液培养出新生隐球菌时,应根据临床情况判断是否为肺隐球菌感染。当AIDS患者体内分离出新生隐球菌是则应高度警惕。对怀疑肺隐球菌感染的病例,在条件允许时应尽量经有创性检查采集组织标本,进行病原学检测。经皮肺穿刺活检、细针抽吸、经支气管镜防污染毛刷获得的标本,经镜检和（或）培养出新生隐球菌则具有诊断价值。
2、 免疫学试验 隐球菌的厚荚膜内含特异抗原性多糖体,约90%的隐球菌脑膜炎患者的血清或脑脊液中可检出该抗原或相应抗体。但由于患者血清中可侧到的抗体不多,且特异性不强,假阳性率高,因此抗体检测的临床价值不高。临床常用的是抗原检测,即应用乳胶凝集试验检测隐球菌荚膜多醣体抗原,这是一种简便、快速、灵敏、特异性强的检测方法,是早期诊断的主要手段。
3、 影像学检查 胸部X线片多表现为双侧多发性病变,亦可为单侧或局限于某一肺叶,其表现类型多种多样：
①孤立性块影,直径2~7cm；
②单发或多发结节影；
③单发或多发斑片状影,约10%患有空洞形成,常为继发性肺隐球菌病；
④弥漫性粟粒状阴影；
⑤急性间质肺炎型,此型少见。所有类型中钙化和干酪性坏死罕见,可有空洞形成。
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