qPCR仪包括光路系统、检测器、热循环模块和分析软件。
常用的荧光激发方式有三种
激光
激光是纯粹的单色光，用来做荧光染料的激发光强度超级高而且基本上没有背景干扰，但激光光源的价格也和性能一样高高在上，市场上只有最高端的定量PCR设备才会使用激光光源，价格和性能都令我们绝大多数的普通用户高山仰止。
卤钨灯
相对于中低端设备使用的单色LED而言，卤钨灯或者氙灯的价格比较贵，需要定期维护和更换，但激发光的光谱范围比较宽，相对光强也较强。过去卤钨灯一般都会在中高端定量设备中配合冷CCD检测器使用，近年来随着白光LED技术的发展，因寿命长和良好的性能表现，逐步登上并占据了定量PCR的硬件舞台。
LED
单色LED光源成本低、寿命长，使用期间基本无需维护，目前在中低端定量PCR市场中几乎占据了统治地位；近几年发展起来的白光LED兼具卤钨灯光谱范围宽和LED性能稳定寿命上的优点，在中高端定量PCR仪中使用较多，但需要注意的是各个厂商所使用的白光LED性能各异，有些劣质LED的光谱范围不够平均，就会导致某些特定激发通道的光强明显低于其他通道。
在定量PCR设备中主要使用滤光片进行单色滤光，光栅型单色系统在定量PCR设备中比较少见。
定量PCR设备使用的荧光检测元件常见的也有两种，光电倍增管（PMT）和CCD/CMOS芯片，PMT多用于中低端设备，使用扫描检测模式，在灵敏度上PMT几乎可以达到CCD/CMOS检测的同等水平，但由于光电倍增的工作原理，使用PMT检测一般背景噪音会相对较高，信号基线不够稳定，尤其在孔间和板间重复性上表现明显弱于CCD类型的检测设备。CCD/CMOS价格比较高，一般用于中高端定量PCR设备，使用CCD/CMOS检测的设备一般在孔间重复性上明显好于扫描设备，复孔之间的实验结果相对偏离会较小。
目前市场上还有一些使用光电二极管（PDT）进行检测的定量设备，这种检测元件在成本上与PMT相当，检测结果的背景噪音低于PMT设备，但由于信号放大过程后置，所以检测灵敏度要低于使用PMT和冷CCD的设备，直接的表现就是相同样本检测的时候Ct值出得会比较大。
关于光路系统另一个重要考虑因素就是检测通道数。定量PCR设备通过不同的激发和发射滤光片组合，可以同时检测多种不同的荧光染料，也就是我们所说的检测通道数。
市场上常见的定中低端荧光定量PCR仪一般会提供2-3个检测通道，高端设备一般都具有5-6个检测通道，我们在选择通道数量时应该根据自己的实际使用需要来进行选择。对于实验条件和对象经常变化的研究型实验室来说，多通道不但意味着可以同时进行多重实验，也同时提供了极高的染料和方法适应能力。
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