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薄层色谱法（TLC）是快速分离和定性分析少量物质的一种很重要的实验技术。中国药典2010年版以石油醚（60～90℃）－乙醚（4:5）为展开剂，2%香草醛的10%硫酸乙醇溶液为显色剂，并规定该法为青蒿素的鉴别方法。薄层色谱扫描法（TLCS）应用于青蒿素的定量分析具有灵敏度及分辨率高的优点，但重现性、可比性欠佳。
气相色谱法（GC）不宜直接用于青蒿素的定量分析，这是由于青蒿素具有热不稳定性，170℃以上就会开始分解。因而，只有通过寻找分解产物与青蒿素之间的线性关系来间接实现定量。
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