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原核生物mRNA的降解是不同核糖核酸酶包括核酸内切酶,3'核酸外切酶和5'核酸外切酶的共同作用的结果。在一些情况下,长度为数十至数百个核苷酸的小RNA分子(sRNA)可通过与互补序列碱基配对来促进RNase III对特定mRNA的降解。