厌氧性细菌 （anaerobic bacteria ）指在无氧条件下生活的细菌。为好氧性细菌的对应词。其中，在氧存在下不能生长的细菌，特称为专性厌氧菌，如梭菌、甲烷菌、硫酸盐还原菌以及大部分光合细菌。与此相反，无论有氧状态还是无氧状态都能生长发育的细菌，则称它为兼性厌氧细菌。专性厌氧菌除通过发酵，光合作用获得能量外，有的能把硫酸盐那种的无机氧化物作为末端电子受体而加以利用。据认为，在专性厌氧菌中，通过发酵获得能量的一般都缺少细胞色素或过氧化氢酶，氧对生长，其所以有害，是由于缺少超氧化物不均化酶和过氧化氢酶，而对由黄素系氧化酶的作用而产生的有害的超氧化物或过氧化氢不能分解所致。在土壤中与好氧菌共存时，在有通透空气的地方也可发现有厌氧菌的存在。在兼性厌氧菌中，很多是像大肠杆菌那样，有氧存在时是借助呼吸，氧不存在时是借助发酵来获得能量的。但也有的像乳酸菌那样，即使有氧存在，主要也是借助发酵来获得能量。因而即使是兼性厌氧菌，其中也包括从在有氧条件下生长十分良好的直到无氧条件下生长十分良好的各种各样的情况。
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