由于甲硝唑被还原的中间产物对氧十分敏感，所以在有氧环境下容易失活，故只对厌氧菌发挥作用。但厌氧菌感染多为混合感染，即厌氧菌和需氧菌掺杂，两种细菌互相促进生长，因此在治疗厌氧菌感染时，须采用分别对需氧菌和厌氧菌敏感的药物，一般与头孢类药物合用，提高疗效。
由于厌氧菌培养需要一定的条件和时间，所以常在获得实验结果以前，医生已作出抗厌氧菌治疗的决定。因为感染的常见部位为口腔、腹腔、肠道及盆腔等，所以当这些部位发生感染性疾病时，治疗上一般会使用抗厌氧菌类药物。此外，当脓液或渗出液有腐败性臭味或甜味时，提示厌氧菌感染的可能性大。
首页
