硬骨鱼的不完全卵裂形成胚外卵黄囊。卵黄囊最主要的功能是为发育的胚胎和仔稚鱼提供营养，另外还有气体交换与排泄作用。卵黄囊最典型的特征是卵黄多核层（ysl）。
Ysl来自于卵裂早期收缩的边缘分裂球，并在卵黄细胞和内部细胞团块（ICM）之间形成多核体，后者是胚胎前体。研究指出，硬骨鱼类早期生活史中的ys也被视为胚盘外包的主要动力。 广泛认为，表胚层”中线粒体的高频出现，是它作为外包驱动力的证明。早期胚胎发育中，前神经组织的诱导和体轴腹外侧中胚层的形成，以及腹外侧边缘分裂球的节-相关非基因的诱导，都归功于ysl表达基因的控制。Ysl的功能与组织上皮的形态发生、心脏组织形态发生以及肝脏芽的形成有关。
在硬骨鱼胚胎中，ysl连同中胚层及外胚层围绕整个卵黄块分布。与非硬骨鱼类半斑目、弓鳍目、鲟目和其他一些较低级的脊椎动物相反，在胚胎和早期仔稚鱼“卵黄囊幼鱼”发育时期，硬骨鱼内胚层和卵黄储备之间并没有关系。卵黄流通有专门的静脉血管，在卵黄囊的壁中发育。通常，在肝脏入口系统形成卵黄，肠道前体血管和血管网状组织作为肝静脉的一部分。在硬骨鱼胚胎和仔稚鱼中，所有从机体发出的较大血管为卵黄囊提供血液。然而，许多物种，如金头鲷、黑鲈、梭鲈（白梭吻鲈）或大比目鱼（大菱鲆），在早期发育阶段并不具有卵黄囊循环。最近有关狼鲈（条纹鲈）仔稚鱼的研究结果，与在海鲷、黑鲈、梭鲈和大比目鱼中报道的结果一致。在孵化后1天、3天，狼鲈仔稚鱼卵黄囊中未发现血管。 总结认为，大比目鱼卵黄囊中缺少血液循环系统，但并不妨碍从卵黄细胞到胚胎发育，或仔稚鱼的营养吸收和转移。
卵黄囊储备的大部分营养需通过ys/yt到达胚胎及仔稚鱼组织，在此过程中，apoE基因的表达必不可少。已有科研人员研究了内源营养的细胞学基础，尤其是硬骨鱼胚胎及仔稚鱼/初孵鱼苗中卵黄储备物的利用。迄今为止，大多数研究已经确定了卵黄利用在硬骨鱼发育中的作用。
棕鳟（亚东鲑鱼）的ysl结构在孵化之后很快在细胞质区域（ycz）组成。Ysl细胞质区域的细胞器与鲑鱼初孵鱼苗、大西洋庸鲽及梭鲈仔稚鱼以及狼鲈类似。Ycz是一个相当复杂的结构，涉及卵黄水解、脂蛋白微粒合成及将它们运送至卵黄的循环。Ycz包含平面和粗面内质网、大量线粒体及高尔基体复合物。所有这些部分延伸穿过Ycz的细胞器，能形成分层结构。然而，一些鱼类尽管存在细胞器，但似乎并不含分层的“表胚层”，如大西洋鳕鱼、大西洋庸鲽、海鲷、海鲈、碧古鱼及白鲈。
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