阿米巴病呈世界性分布，全球高发地区位于墨西哥、南美洲东部、东南亚，西非等，地处北纬10°至南纬10°之间的热带和亚热带地区，平均感染率在20％以上，个别地区如埃及可达57％～87％。
据报告，我国近年的人群感染率在0.7％～2.17％之间，大多见于经济条件、卫生状况、生活环境较差的地区，农村高于城市。人群的感染主要通过人际经口传染，主要传播环节是被含有包囊的粪便污染的水源。
居民点的水源被污染常酿成该地区的爆发流行和异乎寻常的高感染率；其次是手指、食物或用具的被污染；卫生习惯不良的带虫者是危险的传染源，蝇及蟑螂等昆虫也能对包囊起一定的传播作用。
由于缺乏有效的获得性免疫，患过阿米巴病的人仍是易感者。易感性与性别，年龄无相关性，流行统计中的男性高发现象，多与生活习惯和职业等因素有关。
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