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生长素主要的合成部位是具分生能力的组织，主要是的幼嫩芽、叶和发育中的种子。生长素在植物体内的各器官都有分布，但相对集中分布在生长旺盛的部位，如胚芽鞘、芽、根顶端的分生组织、形成层、发育中的种子和果实等处。
生长素在植物体中运输有三种方式：横向运输、极性运输、非极性运输。横向运输（单侧光照引起的胚芽鞘尖端中的生长素背光运输、横放时植物根与茎中生长素的近地侧运输）。极性运输（从形态学上端运输到形态学下端）。非极性运输（在成熟组织中，生长素可以通过韧皮部进行非极性运输）。
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