其实你要首先理解一下电泳染色的原理.
电泳时,我们一般使用的染色剂比如EB啊,GEL-Red啊之类的,都是潜入DNA双螺旋的分子间,所以能拿来作为结合染色染料.而对于RNA,其大多为单链形式存在,这些染料还能进行染色的原因,是因为其的大分子还能发生自身或相互间的2级缠绕,使得染料还有掺入的余地.
那么,如果这些大分子发生降级或者片段化成为小片段,发生自身缠绕的和相互聚合的几率及小了很多,染料难于掺入,当然不显色.
而对于测OD值来说,我们关注的是其吸光度,吸光度这与RNA中的碱基有关,与分子结构无关,所以当然能测出值来.并且,降解和片段化的程度越高,暴露出的碱基愈多,吸光度也越大,测出的值当然也越高,这是不矛盾的.