各类型的肥大细胞增生病在组织学亡均有共同的特点，即其皮疹内含有肥大细胞浸润。肥大细胞胞质内有异染颗粒，为粘多糖组成。这些颗粒在常规染色切片内，一般看不见，但用Giemsa或甲苯胺蓝染色时则清晰可见，呈异染性。值得提出的是在处理活检标本时，特别是在取材操作方面，要注意轻巧细致，以免肥大细胞的颗粒脱失。肥大细胞的形态随其周围组织而有所不同，可出现各种形态，如扁平状、球形、梭形或星形，甚至呈线状。比较肥胖的细胞其直径可达8～15μm。胞质内的颗粒最大直径可达0.6～0.7μm。组织液增多，机械刺激及放射线等均可引起肥大细胞的脱颗粒现象。在此情况下，至少在一段时间内，在基质中出现颗粒物质，而这些颗粒也可被巨噬细胞所吞噬，这样就影响对肥大细胞的辨认。
各类型的病变虽然本质相同，但其浸润的多少与分布各有不同，故分述如下：
(一)单发结节型或多发结节型 肥大细胞多而密集，呈肿瘤样团块。浸润可充满整个皮肤，自表皮下乃至皮下组织均可见密集的肥大细胞。当肥大细胞致密聚集时，肥大细胞形态则立方形多于梭形。胞质内颗粒很清晰。因而常在HE切片时，不需作特殊染色即可辨认。
(二)播散性色素性荨麻疹 肥大细胞聚集比上述一型中为少，浸润也比较浅在，主要在真皮上1／3，接近表皮。细胞形态偏向于纺锤形，如没有异染颗粒的特点，几乎或完全不能辨认为肥大细胞。在有些病例的早期皮疹中，肥大细胞可能堆积于较大的血管周围，呈灶状分布。儿童患者在斑丘疹基础上可能发生大疱，大疱在表皮下，用嗜银染色时，疱底显示嗜银纤维网内充满了肥大细胞。
(三)TMEP型 表皮下乳头层内毛细血管扩张，周围散布肥大细胞，有些肥大细胞核可呈圆形或卵圆形，但大多数核呈梭形。由于肥大细胞数目较少，而且在HE染色切片中，此种肥大细胞类似成纤维细胞，因此，除非用特殊染色，否则很易漏诊。
(四)弥漫型或红皮症型 表皮下可见致密肥大细胞浸润，分布呈带状。细胞形态甚一致，核圆形或卵圆形。
(五)大疱型 在儿童可发生大疱，主要见于单发结节或弥漫性红皮症型，均发生于表皮下，但由于水疱基底的表皮再生，陈旧性水疱可位于表皮内。在水疱内，除有嗜酸性及中性粒细胞外，往往含有肥大细胞。因此，临床上对大疱型患者可取水疱内容作细胞学检查，以供快速诊断用。
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