①奎宁每日用量超过1g或连用较久，常致金鸡纳反应，此与水杨酸反应大致相似，有耳鸣、头痛、恶心、呕吐，视力听力减退等症状，严重者产生暂时性耳聋，停药后常可恢复；
②24小时内剂量大于4g时，可直接损害神经组织并收缩视网膜血管，出现视野缩小、复视、弱视等；
③大剂量中毒时，除上述反应加重外，由于抑制心肌、扩张外周血管而致血压骤降、呼吸变慢变浅、发热、烦躁、谗妄等，多死于呼吸麻痹；
④奎宁致死量约8g；
⑤少数病人对奎宁高度敏感，小量即可引起严重金鸡纳反应；
⑥少数恶性疟患者使用小量奎宁可发生急性溶血（黑尿热）致死；
⑦奎宁还可引起皮疹、瘙痒、哮喘等。
白细胞减少，头痛，眩晕，耳鸣，可引起胃肠道反应：恶心呕吐，食欲不振，腹胀，腹泻。视物模糊（复视），听力下降。特异质者出现急性溶血，血管神经性水肿，支气管哮喘。剂量过大时有心源性虚脱，心动过速，呼吸困难，妊娠期可引起流产。光敏反应。严重过量时呼吸困难，死亡。
【心血管系统】高度敏感的人长期应用正常量，或过量，心电图上可见QRS增宽、ST延长、T波改变、传导紊乱或室性心动过速。严重中毒者可发生循环虚脱。
【呼吸系统】可出现过敏性哮喘，奎宁中毒时可导致呼吸受抑制。
【神经系统】可出现头痛、耳鸣、眩晕，中毒可引起惊厥及昏迷。也可发生肌病。
【消化系统】常见有恶心，过量可致有腹痛及腹泻。1例发生肉芽肿性肝炎，表现为发热、恶心、呕吐及多关节痛。
【泌尿系统】奎宁中毒时可发生肾衰，可能由于循环衰竭之故。
【造血系统】可发生血小板减少，敏感的人甚至小剂量即可出现血小板减少、血小板减少性紫癜或急性血管内溶血伴肾损害或肾衰。应用奎宁治疗时可发生溶血性贫血，即过去所谓的黑水热。个别病例可发生粒细胞减少。
【内分泌、代谢】奎宁可致血糖降低，甚至发生低血糖症，同时血中胰岛素浓度升高。
【特殊器官】黑朦是最严重的不良反应，最明显的症状是视野缩小及视力丧失，停药后可恢复。在早期应用星状神经节封闭治疗黑朦有效。急性奎宁中毒时，首先出现瞳孔扩大，对光反应存在，个别病例的瞳孔可出现蠕动样运动，随后视力完全丧失，多数患者是一过性的，少数为永久性失明。奎宁过量时常见有耳鸣，连续长期应用可致永久性听力障碍。
【皮肤】奎宁皮疹是过敏反应的表现，有发生对阳光过敏者。局部敷奎宁可发生接触性皮炎和对光过敏。
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