1 生物碱
莲子心中的主要成分为不同种类的异喹啉生物碱。从莲子心里提取分离得到的生物碱包括甲基莲心碱、莲心碱、异莲心碱、莲心季铵碱、荷叶碱、前荷叶碱、S-N-甲基异乌药碱。
2 黄酮类化合物
从莲子心分离的黄酮类化合物包括异夏佛托苷、槲皮素-3-O-新橙皮糖苷、夏佛托苷、异鼠李素-3-O-新橙皮糖苷、异牡荆苷、香叶木素-7-O-芸香糖苷、牡荆苷、荭草苷、异荭草苷、芹菜素-6-C-8-C-二葡萄糖苷、芹菜素-6-C-葡萄糖-8-C-鼠李糖苷、芹菜素-6-C-葡萄糖-8-C-木糖苷、芹菜素-6-C-鼠李糖-8-C-葡萄糖苷、芹菜素-6-C-木糖-8-C-葡萄糖苷、异鼠李糖-3-O-芸香糖苷、异槲皮苷、山柰酚-3-O-刺槐双糖苷、5,7-二羟基-4’-甲氧基黄酮-3-O-[α-L-吡喃鼠李糖基]-β-D-吡喃葡萄糖苷、忍冬苷、槲皮素-3-O-葡萄醛酸苷、木犀草素-6-C-β-D-葡萄糖苷、木犀草素-8-C-β-D-葡萄糖苷、金圣草素-7-O-α-L-吡喃鼠李糖基-（1→2）-β-D-吡喃葡萄糖苷。
3 甾醇及其酯
莲子心中含有丰富的植物甾醇和甾醇酯，被誉为“生命的钥匙”。Bi Yanlan等从莲子心毛油不皂化物中分离出β-谷甾醇、△5-燕麦甾醇、菜油甾醇和豆甾醇。莲子心的毛油质量分数为13.63%～14.04%，毛油中的总甾醇含量为10.93～12.76 g/100 g，β-谷甾醇、△5-燕麦甾烯醇和菜油甾醇是甾醇酯中的主要甾醇，亚油酸、油酸和山嵛酸是甾醇酯中的主要脂肪酸。
4 挥发油
莲子心中还含有挥发性成分，主要成分为Z-9,17-十八碳二烯醛、8,11-十八碳二烯酸甲酯、14-甲基-十五烷酸甲酯、芳姜黄酮、β-芳姜黄酮、α-芳姜黄酮，棕榈酸甲酯、顺式-9-十六碳烯酸、生育酚、5-羟甲基-2-呋喃甲醛、14-甲基正十五酸、十七烷酸、植物醇、9,12-十八碳二烯酸、3,7,11-三甲基-2,6,10-十二碳三烯-1-醇、γ-谷甾醇、γ-生育酚等。
5 多糖
Liao等的研究结果表明莲子心中含有木糖、葡萄糖、果糖、半乳糖和海藻糖等水溶性多糖。
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