全世界海马约有354种，大多数分布于热带和亚热带及温带海域，其中70%分布于印度洋太平洋和大西洋。我国海马的主要种类有6种，其中以日本海马分布最遍及我国南北各海域；而冠海马则仅产于渤海和黄海北部；其他种类如大海马、刺海马管海马和三斑海马，以南海较多，主要分布于广东海南福建台湾和广西等省自治区沿海一带。
冠海马：黄海、渤海、秦皇岛沿海、塘沽外海、黄河三角洲。
刺海马：东海、南海、台湾、福鼎外海、澎湖外海、高雄外海、陵水外海。
日本海马：南海、东海、黄渤海、北海沿海、澎湖沿岸、大陈岛沿岸、厦门沿海、青岛沿海、平潭岛沿岸、阳江外海、汕尾沿海、秦皇岛沿海、大连外海、烟台外海、屏东外海、营口外海、三亚外海、陵水外海、台州外海。
管海马：渤海、东海、南海、台湾、陵水外海、汕尾外海、厦门外海、陵水河口、兰屿外海。
克氏海马：汕头外海、高雄外海、琼海外海。
三斑海马：陵水外海、东山外海、汕尾外海、厦门外海、高雄外海。
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