应该从酶的结构和酶的作用机理解释。胰蛋白酶的作用中心有Zn2+，Arg127的胍基和Glu270的羧基组成。催化的第一步反应是活化水分子的亲核氧原子攻击底物的羰基碳原子，同时，Glu270作为广义碱，从Zn2+—结合水吸取一个质子，形成一个带负电的四面体过度中间物，通过Zn2+和Arg127带正电的侧链的静电3相互作用给以文帝昂。催化的第二步，Glu270的COOH作为广义酸提供一个质子给肽基的-NH基，肽健随着断裂，释放氨基酸，经扩散离开酶的活性部位，完成水解。从以上过程可以看出，肽链羰基极化是为了使底物更好的与酶的活性部位相结合。
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