衣原体是一种既不同于细菌也不同于病毒的一种微生物，属于原核生物，即细胞内没有形成核膜的细胞核。衣原体是惟一的具有两阶段繁殖周期的严格的细胞内寄生的原核生物。分为代谢不活跃的细胞外期和增殖性细胞内期两阶段。依其抗原性质、形态和所含糖原的不同分为：沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体、肺炎衣原体、兽类衣原体（对人类无致病性）。衣原体的致病机理是抑制被感染细胞代谢，溶解破坏细胞并导致溶解酶释放，代谢产物的细胞毒作用，引起变态反应和自身免疫。衣原体感染可引起子宫感染、早产、流产、尿道感染、肺炎、支气管炎、胃肠炎、脑脊髓炎、结膜炎和关节炎等多种疾病。
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