对于肾功能损伤患者，其剂量必须个体化、以保证有效治疗浓度。调整剂量的方法有几种，但最准确的方法是基于血药浓度进行调整。如果血药浓度不能获得，而患者的肾功能又稳定，测其血清肌酐水平和肌酐清除率是最可靠的。如果肾功能进一步恶化，剂量需要大大减少。对于肾功能正常患者，其初始剂量和推荐剂量相同。对于肾功能不同程度损伤的患者，其全天剂量可以通过以下方法来调整剂量。
1)对于肾功能正常患者，根据血清肌酐浓度，按前述表1所推荐的剂量调整患者的个体剂量。
2)如果肌杆清除率已知，或可经血清肌酐水平计算而得，可用下式计算调整剂量：患者用药剂量=前述表1所推荐剂量×(患者的肌杆清除率/正常人的肌酐清除率)
3)此外，作为可选择的方法，也可根据下图获得由前述表1所得的调整量百分率，其第8小时调整一次。正常人的肌酐清除率可通过血清肌酐水平经计算而得。具体计算方法如下：
(140-年龄)×体重(kg)成人男性的正常肌酐清除率= -72×血清肌酐浓度(mg/100ml)
成人女性的正常肌酐清除率=成人男性的正常肌酐清除率×85%
调整的每日总量可每日一次给药(即每24小时用药1次)也可每日2-3次给药(即每8或12小时用药1次)。一般而言，单次剂量不能超过3.25mg/kg。对于正在接受血液透析治疗的肾功能不全患者，经透析所除去的药物量与所用的依器设备和方法有关。透析间期，推荐成人按2.0mg/kg补充奈替米星，直至血药浓度达所需浓度。此外，剂量尚可根据监测结果进行调整。
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