慢性过量可引发严重的骨髓损害，例如大量出血，危及生命和感染以及神经毒性。
阿糖胞苷的骨髓毒性有其剂量限度。高剂量治疗，每一治疗周期总剂量累积约达标18-36g，严重的的骨髓毒性甚至骨痨可能产生。但这只能在超剂量变1-2周后在临床上显示出来。这与剂量，病人年龄，临床条件以及联用的细胞毒药物有关。怀疑过量的病人要在一段较长的时间内进行短间隔常规血细胞计数。
阿糖胞苷能被血液透析去掉，但在过量病人中使用这一方法尚无报道。
治疗过量：
因无有效的解毒药可以使用，本品每次使用都应极端小心。对过量病人的治疗，多采取支持疗法，如输血和抗菌素治疗。
对疏忽过量的病人，如注射本品至脊髓液严重过量，应及时用生理盐水进行脊髓液交换。
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