终于找到你 | 挑选差异蛋白攻略大全

前两天，我们主要讲了P值得计算方法以及差异蛋白质的筛选标准，那么问题又来了：

费了老大的劲找出的蛋白，我们如何能够快速分辨哪个就是真的差异蛋白呢？有不少客户也经常苦恼我验证不出怎么办呢？现在不用愁了，看完这篇攻略，让您快速找到“心仪”的差异蛋白！

做研究要“有意义”，发文章要“讲故事”。选择与研究相关的蛋白进行后续验证和分析是首要标准，这个“相关”就要我们各位小伙伴们根据前期的数据积累、文献调研和经验去判断了哦！

如果没有特别感兴趣的蛋白，可以重点关注GO和KEGG富集到的相关条目/通路涉及的差异蛋白，这种蛋白可能对实验处理最敏感，最相关，分析起来也更有意义。

有文献报道的蛋白更容易讲故事展开讨论，如果发现文献中还有描述与筛选到的差异蛋白一致的表达趋势，那就赶紧把它加入到你的小本本里，因为这样的蛋白更可能是“真的”差异蛋白，被验证成功的概率也会很高！

攻略4

蛋白的定量值大多来源于肽段定量的中位数，参与定量的肽段数量越多，蛋白定量的准确度就越高。所以，在允许的情况下要尽量选择肽段数量多的蛋白进行后续验证。如果选择的差异蛋白只有一段唯一肽，说明只有一段肽段参与了定量，定量的误差可能会比较大。

差异倍数越大，说明蛋白可能受处理的影响越大；p值越小，说明重复间的数据一致性越好，差异越是显著。这样的蛋白被验证出来的概率也就越大。

您的实验一般都会有重复设置吧，建议挑选在不同重复中表达趋势一致的蛋白验证。如果同样的蛋白质在不同的组别中有着千差万别的表达，那这个蛋白质也太调皮，这样的蛋白太不靠谱啦！

是不是这些实用小技巧都很贴心呢，希望您一直关注，我们的服务也会一直很贴心。做蛋白组学，代谢组学选择中科新生命一定没错！