基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功能的损伤进行了评价。借助于转录组+蛋白组联合分析,研究者进一步鉴定出phosphodiesterase 10a(Pde10a)是miR-137的重要调控靶点。
文献小笔记
Partial loss of psychiatric risk gene Mir137 in mice causes repetitive behavior and impairs sociability and learning via increased Pde10a
Nature Neuroscience IF=19.912
原文链接:https://www.onacademic.com/detail/journal_1000040907544310_8357.html
研究材料与方法
Mir137-knockout mice
(1)评价miR-137KO后神经功能受到的影响:
● 突触可塑性:免疫组化,spinedensities,dendritic length,等
● 学习记忆能力:Morriswater maze test,Barnes maze test,long-termpotentiation (LTP),等
● 重复行为与社交能力:marbleburyingtest,social interaction test,thethree-chamber test,等
(2)蛋白组分析:
● 技术:TMT定量
● 样本:皮层组织
● 组别与重复:Mir137+/+,Mir137+/–, and Mir137–/–,每组两个生物学重复(来自于两窝)
(3)转录组分析:
样本同蛋白质组
(4)转录组+蛋白组联合分析寻找miR-137直接调控靶点:
Sylamer算法比对UTR匹配富集结果与蛋白差异表达的相关性,以及进一步比对mRNA差异表达水平
(5)验证miR-137直接靶点:
luciferase reporter assay,UTR突变
研究内容与结果
1.突触蛋白免疫组化、树突长度等分析,揭示miR-137 KO可导致神经可塑性受损。
Fig. 2 |Loss of miR-137 in the nervous system leads to synaptic overgrowth and impaireddendritic growth in vivo
2.多种行为测试揭示miR-137 KO可导致学习记忆功能失调。
Fig. 3 | Partial loss of miR-137 leads to the learningand memory deficits.
3.多种行为测试揭示miR-137 KO可导致社交能力改变。
Fig. 4 | Partial loss of miR-137 causes impaired socialbehaviors in mice