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蛋白质双向电泳(two-dimensional electrophoresis)过程与体会-2

2020.9.01
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

2.3.2 第二向SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)

选用DYY-Ⅲ型(北京六一仪器厂生产)电泳槽(规格为200×200×1mm),分离胶浓度为12%,无浓缩胶。待胶聚合后,将电聚焦后已经平衡的胶条平放于浓缩胶顶端(避免胶条拉直),并用1%琼脂糖(电极缓冲液配制)封胶,特别应注意避免胶条与分离胶上沿产生气炮。61 厂板子之灌胶:坚决不用凡士林,用透明胶将两端(板子的2 边)封住,再用2%琼脂之SDS-PAGE 电极液封底,待琼脂凝固后再灌胶,最后用水封胶。over!

做之前,一定要保证,1,灌胶不会有任何问题,不能漏,2,不用浓缩胶,只用分离胶。3,分离胶用水封,要保证凝聚好的PAGE 胶,为一平的线,凹来凸去的就不要用了。玻璃版能用硅化剂最好不过了。防止从边上漏,我用透明胶(约4cm宽),封住两边,下面还是用2%的琼脂封。灌好电极缓冲液[25m mol/LTris,192m mol/L 甘氨酸及0.1%SDS],按25mA/板胶恒流进行电泳,待溴酚兰离底部1cm时即可停止电泳,一般电泳耗时约4-5h。银染:凝胶于40%甲醇,10%醋酸中固定1h以上或者过夜;用水洗1次,5min;30%乙醇洗2×20min;水洗6×5min; 0.02%硫代硫酸钠1min;水洗3×20s;0.2%硝酸银,0.02%甲醛快速的润洗一次,就是过一下的意思,到这个溶液进去,马上又倒掉;0.2%硝酸银,0.02%甲醛20min;水洗3×20s;显色液(3%碳酸钠,0.05%甲醛,0.0005%硫代硫酸钠)快速的润洗一次,就是过一下的意思,到这个溶液进去,马上又倒掉;显色液(3%碳酸钠,0.05%甲醛,0.0005%硫代硫酸钠)显色到你所希望的程度,自己看,背景好,点又多的话就可以了;水洗20秒;0.05%甘氨酸停显。染色理想温度:我去年4,5月时,通常染色都定在中午,12点多;温度最好是20 度左右,(这个温度我也没控制的)100%TCA领一瓶TCA 500g的那种 按分子克隆上的好象是直接加200多ml 水就成100%TCA了10%TCA,0.07%2-ME 丙酮 (100ml):

100%TCA 10ml

2-ME 0.07ml

丙酮 90ml

0.07%2-ME 丙酮 (100ml):

2-ME 0.07ml

丙酮 100ml

0 Farrel 液(9.5M Urea,2%NP-40,0.4%Am3.5~10,1.6%5~7,5% 2-ME)

50ml

Urea 28.5g

NP-40 1ml

Ampholine 5~7 2.0ml

3.5~10 0.5ml

2-ME 2.5ml

注意定容!配好后用1.5ml 管分装!-70度保存

注意 这两个溶液 配的时候 比如配 50ml 用100ml的烧杯 用量筒量50ml 水 倒如烧杯里面,用记号笔标上刻度,然后把水倒掉,再称 尿素 小量加水,因为尿素加水后体积会变大,再37 度水域锅里溶,然后加其它成分,最后再定到50ml

(2002-10-30 18:39:37)

UKS液 (含9.5M Urea,5mMK2CO3,1.25%SDS,0.5%DTT,2%Ampholine(3.5~10),6%Triton X-100)

25ml 50ml

Urea 14.25g 28.5g

K2CO3 17.25mg 34.5mg

SDS 0.3125g 0.625g

DTT 0.125g 0.25g

2-ME

Ampholine(3.5~10)1.25ml 2.5ml

Triton X-100 1.5ml 3ml(0.86ml 2 枪,4枪)

2-ME 可适当加一些!注意定容!配好后用1.5ml管分装!-70度保存!

双向电泳IPG(summer)

一、样品提取:三氯醋酸—丙酮沉淀法

(1)在液氮中研磨叶片

(2)加入样品体积3倍的提取液在-20℃的条件下过夜,然后离心(4℃8000rpm以上1 小时)弃上清。

(3)加入等体积的冰浴丙酮(含0.07%的β-巯基乙醇),摇匀后离心(4℃8000rpm以上1小时),然后真空干燥沉淀,备用。


(4)上样前加入裂解液,室温放置30 分钟,使蛋白充分溶于裂解液中,然后离心(15℃8000rpm以上1小时或更长时间以没有沉淀为标准),可临时保存在4℃待用。

(5)用Brandford法定量蛋白,然后可分装放入-80℃备用


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