棉铃虫(Helicoverpa armigera)，是夜蛾科昆虫的一种，寄主植物有20多科200余种，其中大部分为重要栽培作物，是棉花的主要害虫之一。棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)是一种杆状病毒,能专一性地感染棉铃虫，作为生物杀虫剂已得到广泛应用。
近日澳大利亚昆士兰大学的研究人员对棉铃虫免疫系统是如何应答并抵御HaSNPV侵染的机制进行研究，并将研究成果发表在Journal of Virology的10月刊上*。研究人员首先通过对感染HaSNPV的棉铃虫进行小RNA深度测序(LC Sciences，联川生物美国母公司提供技术服务)，发现大量small read(约20个核苷酸)可比对至HaSNPV基因组，并且这些Read比对到病毒基因组热点区的特定开放阅读框(ORF)上，这些ORF大部分为结构基因和辅助晚期基因。随后，利用miRDeep在HaSNPV基因组上预测可做为pre-miRNA的潜在茎环结构。通过分析小RNA序列与潜在茎环结构的比对结果，Read count，负义链数量，双链碱基配对数量以及其他参数，研究人员判定所有预测的茎环结构都不符合pre-miRNA的特征。在排除这些小RNA是 miRNA的可能性后，这些小RNA被认定是由Dicer-2，昆虫中参与RNAi应答的主要酶，加工产生的病毒短干扰RNA(v-siRNA)。
上述研究表明，昆虫中RNAi途径在抗RNA病毒应答过程中发挥着主要作用。应答过程为剪切双链RNA基因组或复制过程中产生的中间体成为v-siRNA，然后通过降解病毒转录本以达到抵御病毒侵染的目的。
*：Jayachandran B, Hussain M, Asgari S. (2012) RNA interference as a cellular defense mechanism against the DNA virus, baculovirus. J Virol [Epub ahead of print].
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