苯丙酮尿症（PKU）是一种先天性代谢障碍病，由苯丙氨酸代谢途径中的酶缺陷所致，因患儿尿液中排出大量苯丙酮酸等代谢产物而得名。低苯丙氨酸饮食疗法是治疗PKU 唯一方法，以控制血中苯丙氨酸浓度在20-100 mg/L 之间，因此以低苯丙氨酸含量的高F 值低聚肽限制膳食中苯丙氨酸过多摄入就是行之有效的治疗方法。此外，富含亮氨酸等疏水性氨基酸的寡肽，能刺激胰高血糖素分泌，降低胆固醇；增加甲状腺素分泌，造成内源性胆固醇代谢亢进；促进粪便中甾醇排泄，降低血清胆固醇浓度。摄入含有大量支链氨基酸的蛋白肽类对酒精代谢有积极的作用。服用高BCAA 含量制剂还能缓解和减轻运动障碍性疾病病情，降低血糖。此外，高F 值寡肽还有抑制癌细胞增殖等作用。
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